Bank BPD DIY berupaya meningkatkan sinergi antar lembaga, salah satunya yaitu dengan menjalin kerjasama dengan DIKTILITBANG PP Muhammadiyah se-DIY, Jateng, dan Jatim. Bentuk kerjasama Bank BPD DIY adalah dengan memberikan support kepada Perguruan Tinggi Muhammadiyah Aisyiyah baik berupa pembangunan fisik maupun peningkatan sumberdaya manusia, khususnya para dosen pengajar untuk melanjutkan pendidikan yang lebih tinggi melalui fasilitas-fasilitas yang telah disediakan bank, agar perguruan tinggi tersebut terus maju dan berkembang. Hal tersebut juga merupakan langkah tindaklanjut atas Perjanjian Kerjasama antara Bank BPD DIY dengan PP Muhammadiyah tentang Pengelolaan Keuangan dan Pemanfaatan Jasa Perbankan Berdasarkan Prinsip Syariah yang telah ditandatangani pada 21 Agustus 2023 lalu. Dalam acara ini, Bank BPD DIY diwakili melalui unit usaha syariahnya, yaitu BPD DIY Syariah.
Bertempat di SM Tower & Convention Yogyakarta pada Hari Rabu, 21 Februari 2024, acara tersebut dihadiri oleh Direktur Pemasaran dan Usaha Syariah, Agus Tri Murjanto, bersama dengan Machfud Solichin sebagai Dewan Pengawas Syariah BPD DIY, didampingi oleh Pemimpin Unit Usaha Syariah, Arif Wijayanto beserta karyawan dan pejabat struktural lainnya. Dari PP Muhammadiyah, acara dihadiri oleh Prof. Dr. Bambang Setiaji, M.Si., sebagai Ketua Majelis DIKTILITBANG PP Muhammadiyah, didampingi oleh Prof. Ahmad Muttaqin, M.Ag., M.A., Ph.D., sebagai Sekretaris Majelis DIKTILITBANG PP Muhammadiyah, beserta tim anggota jajarannya, dan segenap rektor dan wakil rektor Perguruan Tinggi Muhammadiyah se-DIY, Jateng, dan Jatim.
Dengan terjalinnya kerjasama antara Bank BPD DIY dan DIKTILITBANG PP Muhammadiyah, diharapkan akan tercipta kemajuan bagi pihak Perguruan Tinggi baik dalam hal pembangunan maupun peningkatan kualitas sumber daya manusia, khususnya para dosen pengajar yang dapat melanjutkan pendidikan lebih tinggi melalui fasilitas-fasilitas yang ditawarkan oleh pihak bank.